Для лиофилизации используют различные аппараты и режимы. Например, во Всесоюзной коллекции микроорганизмов АН СССР лиофилизацию проводят в центробежно-сублимацион-ном аппарате, а досушивание — в сублимационном аппарате.
Концентрированную суспензию микроорганизмов (10s— 10 ° клеток/мл) в защитной среде (снятое молоко + 5% лактозы + 5% сахарозы) разливают по 0,2 мл в ампулы из нейтрального стекла. Ампулы охлаждают до —20, —24 °С с одновременным высушиванием при температуре сублиматора 20, 26 °С, рефрижератора — 45, — 60 °С, при вакууме порядка 1-10 (0,11—0,07 мм рт. ст.). Длительность замораживания — высушивания 5—6 ч, досушивания — 2 ч. Ампулы запаивают под вакуумом и хранят при 4 °С в темноте.